Libération précoce – Caractéristiques et traitement de Gordonia spp. Bactériémie, France – Volume 29, Numéro 5Mai 2023 – Revue Maladies Infectieuses Émergentes
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Affiliations d’auteurs : Hpitaux universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France (A. Barthel, A. Ursenbach, C. Koebel, E. Rougier); Groupement Hospitalier de Mulhouse et Sud-Alsace, Mulhouse, France (C. Kaeuffer, A. Gravet); Hôpital Civils de Colmar, Colmar, France (D. de Briel, J. Dubois, E. Haerrel, V. Gerber)
Gordonie est un bacille aérobie Gram positif à croissance lente de l’ordre Mycobactériennes. Plus de 40 espèces de cette bactérie omniprésente dans l’environnement ont été décrites, dont peu semblent infecter l’homme (1). Certaines infections localisées, postopératoires ou traumatiques ont été décrites (2,3). Chez les patients immunodéprimés, les bactériémies systémiques, bien que relativement rares, peuvent être causées par un biofilm contaminé qui adhère aux dispositifs endovasculaires (4,5). Cependant, les cas d’infection secondaire sont plus rares.
Gordonie la bactériémie n’est pas bien comprise en raison de sa rareté ; de plus, les hémocultures peuvent ne pas être positives avant >4 jours après l’infection (6). L’utilisation du séquençage du gène de l’ARN ribosomique 16S s’est améliorée Gordonie taux d’identification par rapport aux résultats d’autres tests de laboratoire standard, souvent insuffisants, qui ont parfois conduit à des erreurs d’identification (7). Puisqu’il n’existe aucune recommandation standardisée pour le traitement, les cas signalés ont été pris en charge de manière hétérogène (4,5); un schéma thérapeutique unique, une cure de 46 semaines d’un aminoglycoside associé à un carbapénème ou à une fluoroquinolone, développé à partir d’une étude de série de 5 cas et d’une revue de la littérature, a été proposé (7). Parce que certains cas d’infections graves ont été décrits (8), pour clarifier les facteurs de risque et les options de prise en charge, nous avons lancé cette enquête décrivant les caractéristiques des patients afin d’examiner les résultats du traitement des cas de Gordonie bactériémie. Notre étude a été approuvée par le Comité d’Ethique des Facultés et Hôpitaux de Médecine, d’Odontologie et de Pharmacie du CHU de Strasbourg (projet n° CE-2022-112) et déclarée à la Commission Nationale Informatique et Libertés.
Nous avons examiné rétrospectivement les dossiers médicaux de 2 centres de soins tertiaires et d’un hôpital universitaire du nord-est de la France. Notre objectif principal était d’évaluer comment Gordonie les cas de bactériémie avaient été pris en charge. Notre objectif secondaire était d’identifier les facteurs de risque associés à l’infection. Nous avons demandé des informations à partir de la base de données du laboratoire de chaque centre pour collecter toutes les hémocultures testées positives pour Gordonie spp. du 1er janvier 2010 au 31 mai 2021. Nous avons inclus les patients dont les hémocultures étaient positives pour Gordonie échantillonnés pendant leur hospitalisation dans l’un des centres pendant la période d’étude. Nous avons demandé le consentement éclairé en envoyant des informations sur l’étude aux patients ou aux parents des patients pédiatriques. Nous avons exclu les personnes opposées à la participation et les personnes majeures sous tutelle ou curatelle légale. A partir des dossiers médicaux, nous avons collecté des données sur les maladies sous-jacentes et l’immunodéficience ; présence et type d’utilisation de dispositif intravasculaire de longue durée, le cas échéant ; caractéristiques cliniques; sensibilité aux antimicrobiens ; traitements; et les résultats. Nous avons considéré que les résultats étaient favorables lorsque la guérison clinique complète était obtenue, comme déterminé par la normalisation des tests sanguins et des hémocultures négatives répétées. Nous avons recherché les rechutes survenues jusqu’au 31 mai 2022 ou le décès du patient.
Nous avons inclus 10 patients (âge médian 49 ans), parmi lesquels 7 avaient un déficit immunitaire et 6 avaient des facteurs immunosuppresseurs, le plus souvent une dénutrition sévère ou une corticothérapie au long cours (Tableaux 1, 2). La fièvre était le signe clinique le plus fréquent ; aucun site d’infection secondaire n’a été signalé parmi les cas-patients. Prestataires de soins considérés Gordonie un contaminant dans les dossiers médicaux de 5 cas ; 4 patients n’avaient pas de cathéter veineux central, 3 étaient immunocompétents et 1 avait une infection VIH contrôlée. Nous avons identifié des sous-espèces G. crachat, G. bronchiale, et G. aichiensis. Malgré le séquençage du gène de l’ARNr 16S, chez 3 cas, l’identification de la bactérie s’est limitée au niveau du genre (c’est-à-dire, Gordonie spp.). Neuf patients se sont vu prescrire de manière empirique une antibiothérapie, majoritairement par des céphalosporines de troisième génération et des associations -lactamines/inhibiteurs -lactamases, pour une durée médiane de 15 jours. Tous Gordonie spp. étaient susceptibles de traitement dans tous les cas. Dans les 3 cas où un cathéter à long terme avait été retiré, une apyrexie sans récidive a été obtenue quelques jours après le retrait du dispositif ; la durée médiane de traitement était plus courte, 13 jours (extrêmes 015 jours), pour les patients dont les cathéters avaient été retirés que pour les patients dont les cathéters n’avaient pas été retirés (15 jours, extrêmes 732 jours). Un patient a été guéri, tel qu’évalué par l’amélioration clinique et un échantillon de sang répété négatif, par le retrait du dispositif seul sans traitement antimicrobien. Sur 2 patients qui ont présenté des rechutes, 1 s’est rétabli rapidement après le retrait différé du cathéter et l’autre a présenté des rechutes fébriles sans autre cause évidente de fièvre (p. ex., thrombose veineuse), des signes cliniques d’infection du cathéter et des hémocultures répétées positives pour Gordonie.
Dans cette étude, basée sur des informations cliniques provenant d’une vaste série de Gordonie infections bactériémiques chez des patients de plusieurs hôpitaux, nous avons analysé les facteurs de risque quel que soit le statut immunitaire du patient. Nous avons trouvé que les principaux facteurs de risque étaient l’immunosuppression et les cathéters à demeure de tout type, conformément aux conclusions des revues précédentes (4,5,7,9). Le traitement préféré, avec des céphalosporines de troisième génération ou des combinaisons d’inhibiteurs de -lactamines/lactamases pendant 12 semaines, était d’une durée plus courte que dans la plupart des cas précédents et ne correspondait pas au traitement proposé décrit précédemment (4,7). Cependant, les médicaments antimicrobiens utilisés étaient efficaces contre tous Gordonie espèces. Parmi 8 cas-patients avec des résultats favorables, seulement 2 ont reçu un aminoglycoside, suggérant qu’il pourrait être réservé pour une utilisation dans des cas plus graves. La sensibilité des souches à de nombreux antimicrobiens, à l’exception d’une moindre sensibilité au sulfaméthoxazole dans certaines autres études, concorde avec les données publiées ailleurs (4,7,dix,11). Les effets après le retrait du cathéter veineux central étaient incohérents, mais le retrait a généralement donné des résultats favorables. Des effets positifs du retrait du cathéter ont également été rapportés dans d’autres cas et revues (7,9,12).
Notre analyse rétrospective de la prise en charge reflète les difficultés liées à l’identification tardive et l’incertitude sur le caractère véritablement infectieux des Gordonie spp. bactéries. Il existe des différences dans la littérature quant à savoir si une seule hémoculture positive doit être considérée comme une contamination ou une véritable infection. Certaines sous-espèces, telles que G.terrae ou G. crachat, semblent plus susceptibles d’être responsables de bactériémies ; d’autres espèces, telles que G. bronchialesont rarement représentés (4,5). Dans cette étude, G.terrae était présent chez 4 patients, mais G. bronchiale a été trouvé dans au moins 2 cas et a été fortement considéré comme une cause probable de véritable infection.
Dans les cas signalés où Gordonie était considéré comme un contaminant, l’antibiothérapie empirique a été arrêtée après les quelques jours nécessaires pour obtenir des résultats d’hémoculture négatifs, après quoi les signes cliniques ont régressé et les prélèvements sanguins répétés ont été négatifs dans la plupart des cas (9,13). Quelle que soit la signification de ce résultat microbiologique, qu’il soit spécifique Gordonie spp. sont des agents d’infection ou de contamination, un traitement à court terme peut suffire en l’absence d’un cathéter central ou si les échantillons de sang ultérieurs sont systématiquement négatifs, comme décrit ailleurs (13).
L’une des limites de notre étude rétrospective était que les données ont été recueillies sur plus de 11 ans, au cours desquels des variations du niveau de risque et des stratégies de prise en charge peuvent avoir modifié l’expérience du petit nombre (n = 10) de cas-patients inclus. En outre, y compris les cas dans lesquels Gordonie spp. ont été considérés comme des contaminants potentiels plutôt que comme des causes d’infection peuvent avoir des résultats de traitement biaisés positivement. Aucune culture n’a été prélevée sur les cathéters pour confirmer leur rôle dans la bactériémie, et la sensibilité aux antimicrobiens n’a pas été testée dans tous les cas. Ainsi, certaines souches résistantes pourraient exister et n’ont pas encore été identifiées.
En l’absence de recommandations consensuelles, standardiser la prise en charge des bactériémies causées par Gordonie spp. devrait être poursuivi. En cas d’hémocultures positives, Gordonie doit être considéré comme infectieux chez les patients immunodéprimés, en particulier lorsqu’un cathéter veineux central est présent. La monothérapie à base de lactamines peut être prescrite empiriquement avec ajout d’aminosides dans les cas graves. Après le retrait de tout cathéter veineux central et l’amélioration des signes cliniques, l’arrêt des médicaments antimicrobiens après 12 semaines doit être envisagé. Cependant, d’autres études sont nécessaires pour clarifier la durée du traitement et faire des recommandations plus précises sur la gestion d’un cathéter central, en particulier lorsqu’il n’est pas amovible. Des études sur l’efficacité de la thérapie par verrouillage antimicrobien seraient utiles, éventuellement combinées à une antibiothérapie systémique prolongée. Compte tenu de la nature parfois grave de l’infection, en particulier chez les patients immunodéprimés, développer des stratégies de traitement et sensibiliser les cliniciens à la Gordonie– les bactériémies induites seraient d’intérêt de santé publique.
Le Dr Barthel est un médecin résident qui travaille en maladies infectieuses au CHU de Strasbourg, avec un accent sur les infections des dispositifs implantés.
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